中成药与西药最根本的区别在于指导理论的不同，中成药是传统中医的治疗方法，是在中医理论的指导下，用来治疗疾病的，药源主要是天然植物、动物、矿物及其加工制品。而且西药也是现代医学，人们常说的西药，一般都是用化学合成的方法，也有从天然产品中提取出来的。