中老年妇女大量饮用咖啡，会影响身体对于钙质的吸收、引起骨质疏松，而实际上妇女绝经后，每天需要加十倍的钙量。咖啡因本身具有很好的利尿效果，如果长期且大量喝咖啡，容易造成骨质流失，对骨量的保存会有不利的影响。

胃病患者喝咖啡过量可引起胃病恶化。大量喝咖啡影响食欲，可能会引起呕吐和痉挛，也可能出现胃炎和舌苔厚腻，因而会使身体感到疲乏无力。

孕妇饮过量咖啡，可导致胎儿畸形或流产；哺乳妇女喝咖啡，咖啡因会随乳汁进入孩子体内，使孩子烦躁不安、不能入睡。

因孩童肝、肾的发育不完全，解毒能力差，使得咖啡因代谢的半衰期会延长，所以一般说来，12岁以下儿童是需要禁止摄取咖啡因的。就算成天把咖啡当开水喝的欧美人士，对于小孩子喝咖啡也是有很严格的限制。