巧克力吃多了只会出现消化上的问题。就像所有脂肪含量较多（30%以上）的食品一样，巧克力吃多了也会造成肚子疼（比如胃痛、腹胀、腹泻或便秘等）。尤其是淡巧克力，它脂肪更多，而且含有较多的多元醇（食用过多会引起胃痉挛或腹泻）。

巧克力食用过多的解救办法是：喝一杯清茶暖暖肠胃即可。巧克力和奶酪和红酒一样含有酪胺，这是一种活性酸，它也是引起头疼的主要原因之一。这种物质会导致机体产生能收缩血管的激素，而血管又在不停地扩张以抵抗这种收缩，这就产生了烦人的头疼。同样如果你患有月经期综合征的话——这是1／3至1／2的育龄妇女的常见病，建议你还是少吃巧克力。

人们已经注意到，尽管巧克力会让人产生短暂的欣快感，但女性在经期食用过多的巧克力会加重经期烦躁和乳房疼痛。